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奥古尼斯帝国在一个附属小帝国曼台国中设置了异端文明检测器，曼台国崇尚圣甲武神，喜欢用近战的机械武力征服一切，发现所管辖的绿植星出现异常后，派出去的近战军团被罗伦的大量能力增幅战士给秒杀。
罗伦利用遥控机器人军团配合魔傀和炼动战士，将半生物机械兽剿杀，肃清这颗星球。开辟了药剂王朝，与当地人互动，制作大量增强战士战斗力、智力、体力的药剂。找到空间藤萝制作战舰群收纳舱，升级超级皮肤强化液。
罗伦研究曼台国的弱点，制定炼金（药剂）侵略战术，通过增幅药剂，同步将曼台国民洗脑。获取曼台国的机械化改造术，同步改造大量遥控机械兽，投放到各个所属星球。将炼金堡垒进行改造升级，并暗中扩大容量。
随即罗伦悄悄将曼台国吞下，并将附近所有曼台帝国的星球融合，秘密吞并大量稀有金属矿藏，研制特殊合金材料，不过只有增幅有限的魔化效果，其余都得看合金本身的作用。
这一行为触动了另一附属小帝国、飒兰帝国的异端文明检测器，该飒兰帝国智慧极高，对基因的开发运用与奥古尼斯帝国几乎齐肩，拥有大量基因改造战士。
假装没有发现曼台国被罗伦征服，实则派出一名高等级基因改造同化人（真理战士）混进了曼台帝国的中枢院，最后进入炼金堡垒，想要夺下正在升级的堡垒控制权。
罗伦继续放任曼台国做明面上的控制人，实际庞金帝国隐形操控，自己游历到飒兰帝国的星域，依据拓珠遗留下的信息，寻找各个星球上的炼金符文阴印，找到一个就留下自己的炼金符文，一路发现了一个暗藏的庞大炼金符文法阵。
该法阵位于飒兰都朝的王庭中。
王庭代表了飒兰帝国的最顶级科技核心，平时有限开放给飒兰帝国公民或者其他国家的来客参观，即使是隐形状态依旧会被守卫森严的王庭探测出来。
罗伦要想进入王庭内参观必须满足飒兰国王的好奇心，比如献给他一个稀奇古怪的礼物。
罗伦呈上用炼金刻痕封印大转化术的态体转化物（气态、液态和固态无缝转化的礼物），献给飒兰国王，进入王庭。
期间有大监察官怀疑罗伦进入王庭的目的，这大监察官生性多疑，差点就揭穿罗伦的目的，惊心动魄的点燃王庭内隐藏的炼金符文法阵后，却什么也没发生。
罗伦在最后关头成功逃脱，返回炼金堡垒，仔细研究拓珠之后不得其解，却发现堡垒中的人有些异样，实则已经被飒兰帝国的真理战士设置了基因改造锁，自动认同了飒兰帝国的文明。
罗伦不动声色，装作被设置基因改造锁在体内，暗地用炼金术打破了枷锁，并秘密研究这种基因改造锁的构造原理。发挥出一名炼金师出色的本能天赋，将该锁进行反向设置。
不但救回了所有庞金公民，并将出生时就设置了基因改造的飒兰帝国奴役。
炼金堡垒进一步扩增并强化，庞金战士细分为魔傀、血脉战士、半机械化战士、炼动战士、基因战士以及炼金术士团。罗伦研发出超过军级战舰、堪比帝王级战舰的舰群。
在飒兰帝国和曼台帝国设置了不同位置的炼金堡垒传送基站，随即一路追踪拓珠的印记设置符文，直到进入一处被称为“瓦卡洛德深渊”的反引力星域，在内也找到了一处炼金符文法阵并点燃。
发现在瓦卡洛德深渊中无法再出去，居然遇到奥古尼斯超级帝国的战舰群，一番交战获胜，俘虏一批奥古尼斯战士。不过随即又遇到一模一样的奥古尼斯战舰群。
因为遭遇地点是深渊虚幻泥沼，无法启动战舰攻击，对方动用战士狂潮攻击，罗伦同样予以反击，再次胜利。
惊奇的发现这批奥古尼斯战士竟然是同一批人，后发现是奥古尼斯舰队遭遇了瓦卡洛德深渊的空间错层泥沼，如果守在这里，还可以无限刷奥古尼斯战士。
前一批和后一批双方在相遇之后会立刻产生错层涟漪效应，恢复空间平复，但会将平行宇宙的人保留下来，发生生物基因层面的规则突变。相同的两批人会分别变成不同生物。
炼金堡垒开始无限刷怪，后来直到俘虏的战士越来越多，庞金帝国人口爆满（正常空间10人，空间容纳仓150万人），这才依依不舍离开。
发现了这批奥古尼斯超级帝国的舰队原本在追击奥古尼斯元老团。原来奥古尼斯超级帝国内部早就叛乱，紫冠女王当权，麾下有十大异兽基因军团，并研制了一颗威力恐怖的智械星球——凯撒。
发现只有通过集体自杀，瓦卡洛德深渊才能因为没有生命而停止运转，重回正常的光脉星系。
罗伦开始指挥军团剿杀所有生命，然后集体自杀，期间差点因为留下一个活物而导致集体湮灭。
瓦卡洛德深渊消失，炼金堡垒重回宇宙，发现由于深渊消失的影响，在堡垒中的某个区域竟然产生了空间错层泥沼，罗伦借机研发了大量炼金怪物。
带着奥古尼斯帝国元老团和真正的女王朱蒂，打着重振奥古尼斯帝国荣光和拨乱反正的旗帜，开始正面对杠紫冠女王。
恶战连连，敌方被罗伦庞大的军团数量给彻底震惊。
最后智械星球凯撒出现，这家伙就是星球级的超大型机器人，融合了虫洞打击、高纬度射线、正反时间维度攻击等超常规手段，并且整颗星球可以任意编排智械基因序列，带有“大统一文明侵蚀”（把文明带跑偏）、“思绪幻象”（通过强大波线干扰，使所有敌人集体产生恐怖幻觉）、“融合”（智械星球分解，融入到对方社会体系中，造成最根本的文明破坏）。
庞金帝国根本无法抵挡，最后罗伦点燃了第三道炼金符文法阵，引发了之前点燃的法阵响应，形成最强大的炼金极阵。
在整个光脉星系通过零星组成的其他细小符文，组成了威力骇然的星系级法阵，将智械星球绞杀。
但同时其他地方还有6个同样的炼金符文法阵一起被助燃，这让罗伦百思不得其解。
紫冠女王惊恐，死前的那一刻，从其话中罗伦发现了事情并非如此简单，正邪瞬间颠倒。
原来女王朱蒂才是密谋夺权者，出生为炼金圣女的她，自出生以来就掌握了某个炼金传承，不甘心自己不是女王，知道了开启炼金符文极阵的方法，在开启的过程中被紫冠女王发现，立刻出动凯撒镇压。
这帮人逃走，被困在瓦卡洛德深渊中，其身旁传奇炼金师雷兹得以意外逃脱，被凯撒杀掉时一手打造小炼金界，融入自己的传承后身亡。
在小炼金界中的摩圭星诞生，炼金界四周却被进化出来的冥界包围。
小炼金界唯有炼金传承者可逃生，并在打破炼金界后代替雷兹生前的位置，信奉并帮助女王朱蒂。
炼金符文法阵之前被雷兹点燃了6个，而罗伦最后点燃的3个炼金符文法阵，等于是帮助了朱蒂夺权。
知道真相的罗伦对朱蒂的许诺报酬并不感兴趣，且感到愤怒。
两者决裂。
罗伦利用拓珠将小炼金界中得到的卡伦灵魂融合，成为唯一的圣级炼金师，最终将朱蒂杀死。
光脉星系的无尽深空中，虚幻星空之上现出一道新的裂痕……
全书完。